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RhônEco est un programme de recherche pour le suivi interdisciplinaire de la restauration écologique du Rhône. Il permet de comprendre et d'évaluer les effets que les actions de restauration peuvent avoir sur les habitats aquatiques et sur les communautés biologiques (poissons, invertébrés, végétation).
RhônEco est ainsi un observatoire de la qualité écologique du Rhône. Les données collectées depuis plus de 20 ans permettent de mieux comprendre le fonctionnement écologique du fleuve et développer des modèles prédictifs qui servent à sa gestion environnementale. Il s'agit d’outils particulièrement utiles pour la conception des futures actions de restauration.   
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